Genome-wide identification and expression analysis of the SOD gene family in Alternanthera philoxeroides

doi:10.11686/cyxb2023100

Abstract

Abstract:

Superoxide dismutase （SOD） is a conserved antioxidant enzyme， which plays an important role in plant growth and development and stress response. Currently， there is a lack of systematic understanding of the SOD gene family members of Alternanthera philoxeroides （Ap）. This study systematically identified and analyzed the SOD gene family in A. philoxeroides using bioinformatics methods. The physicochemical properties， conserved motifs， gene structure， phylogenetic relationship， miRNA targeting relationship and expression pattern were analyzed. The results showed that a total of 43 ApSOD proteins were identified， of which 22 belonged to the Cu/ZnSOD subfamily and 21 belonged to the Fe/MnSOD subfamily. Protein characteristic analysis showed that 36 ApSOD proteins were hydrophilic proteins， and 37 ApSOD proteins were stable proteins； subcellular localization prediction showed that most Cu/ZnSOD proteins were localized in chloroplasts or the cytoplasm， and most Fe/MnSOD proteins were localized in mitochondria. Conserved domain analysis showed that members of the same subfamily had similar conserved motifs and gene structures. Prediction of miRNA targeting relationships showed that 17 miRNAs target to 14 ApSODs through cleavage or translation inhibition. Expression pattern analysis showed that the expression level of ApSODs were relatively stable in different environmental conditions and tissues. The expression patterns of 6 ApSODs were analyzed by RT-qPCR under herbicide treatment. Six ApSODs were significantly up-regulated within 7 d under oxadiazon and fluroxypyr stresses； under fluoroglycofen stress， the expression of four ApSODs initially increased and then decreased， and then increased again with extended duration of herbicide exposure. Under glyphosate stress， the expression of six ApSODs were significantly up-regulated at 7 d； the expression of four ApSODs were significantly down-regulated at 1 d under isoproturon stress. These results indicate that ApSODs showed different expression patterns under the stress of different herbicides. This study systematically identified and characterized the ApSOD family members and provided a preliminary description of the expression characteristics of six genes under herbicide stress， laying a foundation for further research on the biological role of ApSODs in response to herbicide stress.

Key words: superoxide dismutase, Alternanthera philoxeroides, expression pattern analysis, herbicide

Shuo HAN, Xiao-wen HAN, Yi-feng HU, Zhong-yi CHEN, Yong-xing ZHU, Jun-liang YIN. Genome-wide identification and expression analysis of the SOD gene family in Alternanthera philoxeroides[J]. Acta Prataculturae Sinica, 2024, 33(1): 102-116.

Figures/Tables 10

References 50

1	Sun S A， Deng Z Y， Xiong J Y， et al. Research progress on biological and ecological control of Alternanthera philoxeroides. South China Agriculture， 2022， 16（9）： 164-167.
	孙思昂，邓梓妍，熊佳瑶，等. 空心莲子草生物及生态防治研究进展. 南方农业， 2022， 16（9）： 164-167.
2	Su T， Wu S J， Hu S Z， et al. Advance in invasion and clonal characteristics of the alien species Alternanthera philoxeroides. South China Forestry Science， 2021， 49（1）： 44-47， 54.
	苏田，吴姝瑾，胡姝珍，等. 外来种空心莲子草的入侵及其克隆特性综述. 南方林业科学， 2021， 49（1）： 44-47， 54.
3	Gupta S， Dong Y N， Dijkwel P P， et al. Genome-wide analysis of ROS antioxidant genes in resurrection species suggest an involvement of distinct ROS detoxification systems during desiccation. International Journal of Molecular Sciences， 2019， 20（12）： 3101.
4	Mhamdi A， Van B F. Reactive oxygen species in plant development. Development， 2018， 145（15）： dev164376.
5	Abreu I A， Cabelli D E. Superoxide dismutases-A review of the metal-associated mechanistic variations. Biochimica et Biophysica Acta （BBA）-Proteins and Proteomics， 2010， 1804（2）： 263-274.
6	Dong L， He Y Z， Wang Y L， et al. Research progress on application of superoxide dismutase （SOD）. Journal of Agricultural Science and Technology， 2013， 15（5）： 53-58.
	董亮，何永志，王远亮，等. 超氧化物歧化酶（SOD）的应用研究进展. 中国农业科技导报， 2013， 15（5）： 53-58.
7	Ren Y Y， Jiang H， Ma L， et al. Identification of potato （Solanum tuberosum） SOD gene family and its response in damaged tubers. Journal of Agricultural Biotechnology， 2021， 29（7）： 1248-1259.
	任映玥，姜红，马丽，等. 马铃薯SOD基因家族鉴定及其在损伤块茎中的响应. 农业生物技术学报， 2021， 29（7）： 1248-1259.
8	Hao H D. Studies on the phytotoxicity symptoms of commonly used herbicides to radish and cabbage and the mitigation effects of some antidotes. Zhengzhou： Henan Agricultural University， 2015.
	郝红丹. 常用除草剂对萝卜、白菜的药害和几种缓解剂对其药害的缓解效果研究. 郑州：河南农业大学， 2015.
9	Matters G L， Scandalios J G. Effect of the free radical-generating herbicide paraquat on the expression of the superoxide dismutase （SOD） genes in maize. Biochimica et Biophysica Acta （BBA）-General Subjects， 1986， 882（1）： 29-38.
10	Dong Y. Study on the physiological response of broomcorn millet to different herbicides. Crops， 2022， 38（5）： 255-260.
	董扬. 糜子对不同除草剂的生理响应机制研究. 作物杂志， 2022， 38（5）： 255-260.
11	Gao J M， Xiao Q， Ding L P， et al. Differential responses of lipid peroxidation and antioxidants in Alternanthera philoxeroides and Oryza sativa subjected to drought stress. Plant Growth Regulation， 2008， 56（1）： 89-95.
12	Xu X Y， Shi G X， Wang J， et al. Copper-induced oxidative stress in Alternanthera philoxeroides callus. Plant Cell， Tissue and Organ Culture （PCTOC）， 2011， 106（2）： 243-251.
13	Zang Y， Chen J， Li R X， et al. Genome-wide analysis of the superoxide dismutase （SOD） gene family in Zostera marina and expression profile analysis under temperature stress. PeerJ， 2020， 8（4）： e9063.
14	Song J B， Zeng L M， Chen R R， et al. In silico identification and expression analysis of superoxide dismutase （SOD） gene family in Medicago truncatula. 3 Biotech， 2018， 8（8）： 348.
15	Wang W， Zhang X P， Deng F N， et al. Genome-wide characterization and expression analyses of superoxide dismutase （SOD） genes in Gossypium hirsutum. BMC Genomics， 2017， 18（1）： 376.
16	Feng X， Lai Z X， Lin Y L， et al. Genome-wide identification and characterization of the superoxide dismutase gene family in Musa acuminata cv. Tianbaojiao （AAA group）. BMC Genomics， 2015， 16（1）： 823.
17	Jiang W Q， Yang L， He Y Q， et al. Genome-wide identification and transcriptional expression analysis of superoxide dismutase （SOD） family in wheat （Triticum aestivum）. PeerJ， 2018， 7： e8062.
18	Zhu Y X， Jiang X C， Han X W， et al. Characterization the coding and non-coding RNA components in the transcriptome of invasion weed Alternanthera philoxeroides. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca， 2021， 49（1）： 12242.
19	Yin J L， Wang L X， Zhao J， et al. Genome-wide characterization of the C2H2 zinc-finger genes in Cucumis sativus and functional analyses of four CsZFPs in response to stresses. BMC Plant Biology， 2020， 20（1）： 359.
20	Chen Q， Xu X Y， Wang J C， et al. Identification of a WRKY gene family based on full-length transcriptome sequences and analysis of response patterns under salt stress in Halogeton glomeratus. Acta Prataculturae Sinica， 2022， 31（12）： 146-157.
	陈倩，徐晓芸，汪军成，等. 基于全长转录组的盐生草WRKY基因家族的鉴定及其盐胁迫响应模式分析. 草业学报， 2022， 31（12）： 146-157.
21	Thompson J D， Higgins D G， Gibson T J. CLUSTAL W： Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting， position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Research， 1994， 22（22）： 4673-4680.
22	Zou Z， Huang Q X， An F. Genome-wide identification， classification and expression analysis of Lhc supergene family in castor bean （Ricinus communis L.）. Agricultural Biotechnology， 2013， 2（6）： 44-48， 51.
23	Li Y T， Liu X， Xiao Y X， et al. Genome-wide characterization and function analysis uncovered roles of wheat LIMs in responding to adverse stresses and TaLIM8-4D function as a susceptible gene. The Plant Genome， 2022， 15（3）： e20246.
24	Gasteiger E， Hoogland C， Gattiker A， et al. Protein identification and analysis tools on the ExPASy server//Walker， John M. The proteomics protocols handbook. Totowa： Humana Press， 2005： 571-607.
25	Li W， Zhao L R， Zhang J P， et al. Genome-wide identification and analysis of the DMP gene family in flax（Linum usitatissimum）. Acta Prataculturae Sinica， 2023， 32（3）： 91-106.
	李雯，赵丽蓉，张建平，等. 亚麻DMP基因家族的全基因组鉴定与分析. 草业学报， 2023， 32（3）： 91-106.
26	Yang L， Jiang X C， Yang J， et al. Identification， characterization， and expression analysis of metal tolerance protein （MTP） genes in Alternanthera philoxeroides. Pratacultural Science， 2020， 37（8）： 1516-1527.
	杨蕾，蒋昕晨，杨杰，等. 空心莲子草MTP基因家族的鉴定、特征及表达分析. 草业科学， 2020， 37（8）： 1516-1527.
27	Li Y P， Wei N， Zhai Q Y， et al. Genome-wide identification of members of the TCP gene family in Melilotus albus and their expression patterns under drought stress. Acta Prataculturae Sinica， 2023， 32（4）： 101-111.
	李艳鹏，魏娜，翟庆妍，等. 全基因组水平白花草木樨TCP基因家族的鉴定及在干旱胁迫下表达模式分析. 草业学报， 2023， 32（4）： 101-111.
28	Zhu Y X， Yin J L， Liang Y F， et al. Transcriptomic dynamics provide an insight into the mechanism for silicon-mediated alleviation of salt stress in cucumber plants. Ecotoxicology and Environmental Safety， 2019， 174： 245-254.
29	Tian J， Li Y T， Hu Y F， et al. Mining the roles of cucumber DUF966 genes in fruit development and stress response. Plants， 2022， 11（19）： 2497.
30	Yin J L， Liu M Y， Ma D F， et al. Identification of circular RNAs and their targets during tomato fruit ripening. Postharvest Biology & Technology， 2018， 136： 90-98.
31	Liu J L， Ouyang L J， Zeng J L， et al. Genome-wide analysis of rice SOD gene family and expression research under stress. Molecular Plant Breeding， 2018， 16（9）： 8.
	刘家林，欧阳林娟，曾嘉丽，等. 水稻SOD基因家族的全基因组分析及逆境胁迫下表达研究. 分子植物育种， 2018， 16（9）： 8.
32	Zhang X， Zhang L T， Chen Y Y， et al. Genome-wide identification of the SOD gene family and expression analysis under drought and salt stress in barley. Plant Growth Regulation， 2021， 94（1）： 49-60.
33	Ye W H， Li J， Cao H L， et al. Genetic uniformity of Alternanthera philoxeroides in South China. Weed Research， 2003， 43（4）： 297-302.
34	Gao Z J， Li M， Gao X X， et al. Biological activity of 24 herbicides against Alternanthera philoxeroides （Mart.） Griseb. Chinese Agricultural Science Bulletin， 2010， 26（21）： 256-261.
	高宗军，李美，高兴祥，等. 24种除草剂对空心莲子草的生物活性. 中国农学通报， 2010， 26（21）： 256-261.
35	Ma M Y， Fu J W， Zhu D H， et al. Control effects of three herbicides on the alligator weed Alternanthera philoxeroides. Plant Protection， 2009， 35（4）： 154-157.
	马明勇，傅建炜，朱道弘，等. 不同除草剂对空心莲子草的控制作用评价. 植物保护， 2009， 35（4）： 154-157.
36	Wu T X， He J R， Wang H C， et al. Susceptibility of Alternanthera philoxeroides （Mart.） Griseb to different herbicides. Journal of Weed Science， 2019， 37（4）： 45-49.
	吴田乡，贺建荣，王红春，等. 外来入侵植物空心莲子草对不同除草剂的敏感性. 杂草学报， 2019， 37（4）： 45-49.
37	Su W， Raza A， Gao A， et al. Genome-wide analysis and expression profile of superoxide dismutase （SOD） gene family in rapeseed （Brassica napus L.） under different hormones and abiotic stress conditions. Antioxidants， 2021， 10（8）： 1182.
38	Filiz E， Tombuloglu H. Genome-wide distribution of superoxide dismutase （SOD） gene families in Sorghum bicolor. Turkish Journal of Biology， 2015， 39（1）： 49-59.
39	Han L M， Hua W P， Cao X Y， et al. Genome-wide identification and expression analysis of the superoxide dismutase （SOD） gene family in Salvia miltiorrhiza. Gene， 2020， 742： 144603.
40	Cai K. Bioinformatics and function analysis of SOD gene family in Phyllostachys edulis. Hangzhou： Zhejiang Agricultural and Forestry University， 2018.
	蔡凯. 毛竹SOD基因家族生物信息学与功能分析. 杭州：浙江农林大学， 2018.
41	Feng K， Yu J H， Cheng Y， et al. The SOD gene family in tomato： Identification， phylogenetic relationships， and expression patterns. Frontiers in Plant Science， 2016， 7： 1279.
42	Wang W， Xia M X， Chen J， et al. Genome-wide analysis of superoxide dismutase gene family in Gossypium raimondii and G. arboreum. Plant Gene， 2016， 6： 18-29.
43	Kliebenstein D J， Monde R A， Last R L. Superoxide dismutase in Arabidopsis： An eclectic enzyme family with disparate regulation and protein localization. Plant Physiology， 1998， 118（2）： 637-650.
44	Huang W L. Study on the control of 20% fluroxypyr emulsified oil against hollow lotus seed grass in rice ridge. Modern Agricultural Science and Technology， 2005（8）： 27-28.
	黄蔚兰. 20%氯氟吡氧乙酸乳油防除水稻田埂空心莲子草试验研究. 现代农业科技， 2005（8）： 27-28.
45	Lou Y L， Deng Y Y， Shen J L， et al. Effects of mestsulfuron-methyl and glyphosate on acetolactate synthase activities and shikimate levels of Alternanthera philoxeroides. Journal of Plant Protection， 2005（2）： 185-188.
	娄远来，邓渊钰，沈晋良，等. 甲磺隆和草甘膦对空心莲子草乙酰乳酸合酶活性和莽草酸含量的影响. 植物保护学报， 2005（2）： 185-188.
46	Yu Y K. Study on safety of seven herbicides to water direct-seeding rice. Harbin： Northeast Agricultural University， 2017.
	郁延坤. 7种除草剂对水直播水稻安全性影响的研究. 哈尔滨：东北农业大学， 2017.
47	Guo M J， Shen J， Song X E， et al. Comprehensive evaluation of fluroxypyr herbicide on physiological parameters of spring hybrid millet. PeerJ， 2019， 7（1）： e7794.
48	Tan W， Li Q L， Zhai H. Photosynthesis and growth responses of grapevine to acetochlor and fluoroglycofen. Pesticide Biochemistry and Physiology， 2012， 103（3）： 210-218.
49	Shen L Y. Effect of glyphosate on physiology and growth of Vallisneria natans. Shanghai： Shanghai Ocean University， 2021.
	沈路遥. 草甘膦对苦草生理生长的影响. 上海：上海海洋大学， 2021.
50	Yin X L. Toxic reactivity of wheat （Triticum aestivum） plants to herbicide isoproturon. Nanjing： Nanjing Agricultural University， 2008.
	尹小乐. 除草剂异丙隆对小麦生物毒性的影响. 南京：南京农业大学， 2008.

常用名 Common names	喷洒范围 Spraying range （g·m^-2）	生产商 Manufacturer	试验措施 Test measure
草甘膦 Glyphosate	0.080	江苏快达农化股份有限公司Jiangsu Kuaida Agrochemical Co.， Ltd.， http：//www.kuaida.cn	41%，水剂Aqueous solutions （AS）
异丙隆 Isoproturon	0.050	美丰农业科技（上海）有限公司Meifeng Agricultural Technology （Shanghai） Co.， Ltd.， https：//www.maigoo.com/	50%，可湿性粉剂Wettable powder （WP）
噁草酮 Oxadiazon	0.040	大连越达农药化工有限公司Dalian Yueda Pesticide Chemical Co.， Ltd.， http：//www.lnydnh.com/	13%，乳油Emulsifiable concentrate （EC）
乙羧氟草醚 Fluoroglycofen	0.008	潍坊鸿汇化工有限公司Weifang Honghui Chemical Co.， Ltd.， https：//www.11315.com/ac/bs/10467196	10%，乳油Emulsifiable concentrate （EC）
氯氟吡氧乙酸 Fluroxypyr	0.010	山东绿霸化工股份有限公司Shandong Lvba Chemical Co.， Ltd.， http：//www.lubachem.com/	20%，乳油Emulsifiable concentrate （EC）

常用名 Common names	喷洒范围 Spraying range （g·m^-2）	生产商 Manufacturer	试验措施 Test measure
草甘膦 Glyphosate	0.080	江苏快达农化股份有限公司Jiangsu Kuaida Agrochemical Co.， Ltd.， http：//www.kuaida.cn	41%，水剂Aqueous solutions （AS）
异丙隆 Isoproturon	0.050	美丰农业科技（上海）有限公司Meifeng Agricultural Technology （Shanghai） Co.， Ltd.， https：//www.maigoo.com/	50%，可湿性粉剂Wettable powder （WP）
噁草酮 Oxadiazon	0.040	大连越达农药化工有限公司Dalian Yueda Pesticide Chemical Co.， Ltd.， http：//www.lnydnh.com/	13%，乳油Emulsifiable concentrate （EC）
乙羧氟草醚 Fluoroglycofen	0.008	潍坊鸿汇化工有限公司Weifang Honghui Chemical Co.， Ltd.， https：//www.11315.com/ac/bs/10467196	10%，乳油Emulsifiable concentrate （EC）
氯氟吡氧乙酸 Fluroxypyr	0.010	山东绿霸化工股份有限公司Shandong Lvba Chemical Co.， Ltd.， http：//www.lubachem.com/	20%，乳油Emulsifiable concentrate （EC）

基因 Gene	上游引物序列 Forward primer sequence （5′-3′）	下游引物序列 Reverse primer sequence （5′-3′）	序列长度 Sequence length （bp）
ApSOD8	GAAGAATAACAGGGCTTACACCTG	GCATGGCGTTCACTATCAAAA	145
ApSOD9	AGATGAAGTCCGACACGCG	TCCACCAGCATTCCCAGTAG	202
ApSOD11	ATCATTGACAGCCAGATTCCTC	ACCAATAATACCACAAGCCACTC	156
ApSOD21	GATACCTCCAACACTTCTACTCATGA	TCAAGTCCACCTCAACATTCTTC	151
ApSOD35	CGCTGTCAACCCTCTTGTATG	ATGCGACTTCTTTCTCACTTTCA	200
ApSOD43	CTCTGGGTTGGGCTATTGATT	TCCTGATTTGCGGTAGTTTCA	157
Tubby	CGGTCTAGCCGAAGATTCCA	CGCTTGGTGAAGGCAGACATT	232

基因 Gene	上游引物序列 Forward primer sequence （5′-3′）	下游引物序列 Reverse primer sequence （5′-3′）	序列长度 Sequence length （bp）
ApSOD8	GAAGAATAACAGGGCTTACACCTG	GCATGGCGTTCACTATCAAAA	145
ApSOD9	AGATGAAGTCCGACACGCG	TCCACCAGCATTCCCAGTAG	202
ApSOD11	ATCATTGACAGCCAGATTCCTC	ACCAATAATACCACAAGCCACTC	156
ApSOD21	GATACCTCCAACACTTCTACTCATGA	TCAAGTCCACCTCAACATTCTTC	151
ApSOD35	CGCTGTCAACCCTCTTGTATG	ATGCGACTTCTTTCTCACTTTCA	200
ApSOD43	CTCTGGGTTGGGCTATTGATT	TCCTGATTTGCGGTAGTTTCA	157
Tubby	CGGTCTAGCCGAAGATTCCA	CGCTTGGTGAAGGCAGACATT	232

蛋白命名 Protein name	蛋白ID Protein ID	Len （aa）	MW （kDa）	pI	Ins	GRAVY	Sub Loc
ApSOD1	TR111530\|c0_g1_i1.p1	205	21.09	6.85	36.23	-0.259	叶绿体/细胞质Chloroplast/cytoplasm
ApSOD2	TR109813\|c0_g1_i1.p1	153	15.73	5.86	30.27	-0.311	叶绿体/细胞质Chloroplast/cytoplasm
ApSOD3	TR241345\|c0_g1_i1.p1	157	16.37	6.28	33.59	-0.494	线粒体Mitochondrion
ApSOD4	TR236337\|c0_g1_i1.p1	117	12.99	6.40	8.93	-0.710	细胞质Cytoplasm
ApSOD5	TR248740\|c0_g1_i1.p1	90	9.69	9.38	14.36	-0.171	叶绿体Chloroplast
ApSOD6	TR126747\|c0_g1_i1.p1	100	10.19	6.45	17.99	-0.353	细胞质/线粒体Cytoplasm/mitochondrion
ApSOD7	TR213092\|c0_g1_i1.p1	154	15.42	6.02	16.32	-0.078	叶绿体/细胞质/线粒体/细胞核Chloroplast/cytoplasm/mitochondrion/nucleus
ApSOD8	TR54897\|c0_g1_i1.p1	157	16.08	6.62	19.40	-0.154	叶绿体Chloroplast
ApSOD9	TR34452\|c3_g1_i3.p1	223	22.70	5.72	24.53	0.066	叶绿体Chloroplast
ApSOD10	TR14803\|c0_g1_i1.p1	79	7.98	5.84	10.50	-0.101	叶绿体Chloroplast
ApSOD11	TR110003\|c0_g2_i1.p1	152	15.18	5.28	21.72	-0.145	叶绿体Chloroplast
ApSOD12	TR37745\|c0_g1_i1.p1	159	16.18	6.02	27.11	-0.181	叶绿体/细胞质Chloroplast/cytoplasm
ApSOD13	TR262285\|c0_g1_i1.p1	215	22.40	6.14	25.46	0.065	叶绿体Chloroplast
ApSOD14	TR60741\|c0_g1_i1.p1	212	22.59	6.28	23.55	0.033	叶绿体Chloroplast
ApSOD15	TR41468\|c0_g1_i1.p1	195	20.46	7.05	34.70	0.027	叶绿体Chloroplast
ApSOD16	TR279215\|c0_g1_i1.p1	101	10.78	5.50	41.45	-0.432	叶绿体/细胞质Chloroplast/cytoplasm
ApSOD17	TR105699\|c0_g1_i1.p1	481	50.96	5.43	19.22	-0.042	叶绿体Chloroplast
ApSOD18	TR109227\|c0_g1_i1.p1	78	8.19	5.44	27.08	-0.251	叶绿体/细胞质Chloroplast/cytoplasm
ApSOD19	TR286036\|c1_g1_i1.p1	338	34.96	5.57	20.15	-0.239	叶绿体Chloroplast
ApSOD20	TR184370\|c0_g1_i1.p1	204	21.48	8.52	32.31	0.309	叶绿体Chloroplast
ApSOD21	TR109991\|c0_g1_i1.p1	309	33.09	5.90	32.53	-0.063	叶绿体Chloroplast
ApSOD22	TR224061\|c0_g1_i1.p1	81	9.10	11.11	62.36	-0.802	叶绿体Chloroplast
ApSOD23	TR20651\|c0_g1_i1.p1	121	13.09	9.11	38.43	-0.426	线粒体Mitochondrion
ApSOD24	TR113639\|c0_g1_i1.p1	97	10.64	9.49	27.21	-0.360	线粒体Mitochondrion
ApSOD25	TR110087\|c5_g5_i2.p1	129	14.27	8.93	37.70	-0.395	线粒体Mitochondrion
ApSOD26	TR110087\|c5_g3_i1.p1	176	19.32	6.28	42.53	-0.305	线粒体Mitochondrion
ApSOD27	TR128622\|c0_g1_i1.p1	77	8.52	8.32	19.26	0.125	线粒体Mitochondrion
ApSOD28	TR47142\|c1_g1_i1.p1	127	13.80	5.73	26.89	-0.157	线粒体Mitochondrion
ApSOD29	TR286587\|c0_g1_i1.p1	227	25.44	9.08	25.84	-0.471	线粒体Mitochondrion
ApSOD30	TR247726\|c0_g2_i1.p1	186	20.75	6.46	54.57	-0.378	线粒体Mitochondrion
ApSOD31	TR247726\|c0_g1_i1.p1	257	28.63	6.96	51.98	-0.191	线粒体Mitochondrion
ApSOD32	TR37189\|c0_g1_i1.p1	217	24.81	9.16	29.34	-0.505	线粒体Mitochondrion
ApSOD33	TR182990\|c0_g1_i1.p3	96	10.75	5.18	32.19	-0.338	线粒体Mitochondrion
ApSOD34	TR137752\|c0_g1_i1.p1	79	8.47	5.61	23.52	-0.446	线粒体Mitochondrion
ApSOD35	TR97445\|c0_g1_i1.p1	275	31.26	5.73	44.15	-0.470	叶绿体Chloroplast
ApSOD36	TR66090\|c9_g1_i1.p1	262	30.14	7.69	30.44	-0.297	线粒体Mitochondrion
ApSOD37	TR266216\|c0_g1_i1.p1	158	18.24	6.39	6.39	-0.492	线粒体Mitochondrion
ApSOD38	TR172914\|c0_g1_i1.p1	215	23.33	7.09	27.29	-0.243	线粒体Mitochondrion
ApSOD39	TR41361\|c0_g1_i1.p1	81	9.40	5.81	38.35	-0.516	线粒体Mitochondrion
ApSOD40	TR272187\|c0_g1_i1.p1	61	6.98	8.82	33.68	0.323	线粒体Mitochondrion
ApSOD41	TR109124\|c3_g1_i1.p1	75	8.97	6.02	38.87	-0.165	线粒体Mitochondrion
ApSOD42	TR110087\|c5_g4_i1.p1	74	8.39	6.78	37.17	-0.324	线粒体Mitochondrion
ApSOD43	TR110087\|c5_g1_i1.p1	148	16.55	6.56	36.08	-0.369	线粒体Mitochondrion