紫花苜蓿CCoAOMT基因家族的鉴定、进化及表达分析

doi:10.11686/cyxb2020429

草业学报 ›› 2021, Vol. 30 ›› Issue (11): 144-156.DOI: 10.11686/cyxb2020429

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紫花苜蓿CCoAOMT基因家族的鉴定、进化及表达分析

马倩(), 闫启, 张正社, 吴凡, 张吉宇()

兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室，兰州大学农业农村部草牧业创新重点实验室，兰州大学草地农业教育部工程研究中心，兰州大学草地农业科技学院，甘肃兰州 730020

收稿日期:2020-09-22 修回日期:2020-11-02 出版日期:2021-10-19 发布日期:2021-10-19
通讯作者: 张吉宇
作者简介:Corresponding author. E-mail： zhangjy@lzu.edu.cn
马倩（1996-），女，甘肃临夏人，在读硕士。E-mail： maq18@lzu.edu.cn
基金资助:
中国科学院战略性先导科技专项(XDA26030103-3);甘肃省科技重大专项计划课题(19ZD2NA002)

Identification， evolution and expression analysis of the CCoAOMT family genes in Medicago sativa

Qian MA(), Qi YAN, Zheng-she ZHANG, Fan WU, Ji-yu ZHANG()

State Key Laboratory of Grassland Agro-ecosystems，Key Laboratory of Grassland Livestock Industry Innovation，Ministry of Agriculture and Rural Affairs，Engineering Research Center of Grassland Industry，Ministry of Education，College of Pastoral Agriculture Science and Technology，Lanzhou University，Lanzhou 730020，China

Received:2020-09-22 Revised:2020-11-02 Online:2021-10-19 Published:2021-10-19
Contact: Ji-yu ZHANG

摘要/Abstract

摘要：

紫花苜蓿是全世界广泛栽培的优质牧草。木质素与紫花苜蓿抗性密切相关，但木质素难以被牲畜消化，严重影响了紫花苜蓿的营养价值，所以培育低木质素的紫花苜蓿具有重要意义。咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶（CCoAOMT）是木质素合成途径中的关键酶，本研究利用生物信息学方法对紫花苜蓿基因组中的CCoAOMT基因家族成员进行鉴定，并对其基因结构、染色体定位、系统发育、基因表达等方面进行了研究。结果表明，在紫花苜蓿基因组中共鉴定到44个MsCCoAOMT基因，其中36个（82%）MsCCoAOMT基因都含有5个外显子，分布于16条染色体上，存在明显的串联重复现象；通过系统发育树分析，MsCCoAOMT基因家族可分为5类；通过MEME软件对MsCCoAOMT蛋白motif进行预测发现了10个比较保守的motif。qRT-PCR表达分析表明部分MsCCoAOMT基因的表达具有组织特异性。研究结果对紫花苜蓿低木质素遗传改良具有潜在的理论指导意义和实际参考价值。

关键词: 紫花苜蓿, 木质素, 咖啡酰辅酶A氧甲基转移酶, 基因家族, 基因表达

Abstract:

Alfalfa （Medicago sativa） is a forage legume with high feed quality widely cultivated all over the world. It contains lignins that play an important role in stress resistance of alfalfa. However， lignin seriously affects the nutritional value of alfalfa because it is difficult for livestock to digest. Therefore， it is necessary to breed alfalfa varieties with low lignin content. Caffeoyl CoA O-methyltransferase （CCoAOMT） is a key enzyme in the lignin synthesis pathway. In this study， the members of CCoAOMT gene family in the alfalfa genome were identified by bioinformatic methods， and the gene structure， chromosome location， phylogeny and gene expression were analysed. It was found that there were 44 MsCCoAOMT genes in the alfalfa genome. These genes were distributed on 16 chromosomes with tandem duplication， among which 36 （82%） MsCCoAOMT genes contained 5 exons. A phylogenetic tree was constructed and showed that MsCCoAOMT family genes can be classified into 5 groups. In addition， ten conserved motifs were found by predicting the motif of MsCCoAOMT protein with MEME software. qRT-PCR results indicated that most of MsCCoAOMT genes were tissue-specific in their expression. Our results provide reference information for the genetic improvement of alfalfa and development of lines with low lignin content.

Key words: Medicago sativa, lignin, caffeoyl CoA O-methyltransferase, gene family, gene expression

马倩, 闫启, 张正社, 吴凡, 张吉宇. 紫花苜蓿CCoAOMT基因家族的鉴定、进化及表达分析[J]. 草业学报, 2021, 30(11): 144-156.

Qian MA, Qi YAN, Zheng-she ZHANG, Fan WU, Ji-yu ZHANG. Identification， evolution and expression analysis of the CCoAOMT family genes in Medicago sativa[J]. Acta Prataculturae Sinica, 2021, 30(11): 144-156.

图/表 8

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基因名称 Gene name	引物序列 Primer sequence （5'-3'）	基因名称 Gene name	引物序列 Primer sequence （5'-3'）
MsCCoAOMT1	F： TGCTGATCCATTGGTAAGTGAC	MsCCoAOMT25	F： CTATACCCGGTGATGAAGGAC
MsCCoAOMT1	R： TTGTCATCCCATCTCCAATAGGT	MsCCoAOMT25	R： CAAAGCCAATACCTTTCCATCAG
MsCCoAOMT10	F： TTCATGGGCACTTCACCT	MsCCoAOMT32	F： CTATACCCGCTGATGAAGGAC
MsCCoAOMT10	R： GGCTGTAATCTTTCCATCATATGG	MsCCoAOMT32	R： AGCCAACACCTTTCCATCCT
MsCCoAOMT12	F： AAGCAAACTGAATCTGGAAGAC	MsCCoAOMT41	F： GGAACCTTATGGCTACACCT
MsCCoAOMT12	R： TTGTCATGATGTTCCATGGGT	MsCCoAOMT41	R： AAGCCAATACCTTTCCATCAG
MsCCoAOMT17	F： TGCCTTTGGATGAAGCAC	MsCCoAOMT43	F： CACCCATGCTTGAAGGAG
MsCCoAOMT17	R： CAATTCCTATTACCTTGCCATCAG	MsCCoAOMT43	R： AGCTAACACCTTTCCATCCT
MsCCoAOMT21	F： GGCTGGTCAACTAATCACTC	MsCCoAOMT44	F： CTAATGGGCATACTCTTGAAGCT
MsCCoAOMT21	R： GGCTGTAATCTTTCCATCGT	MsCCoAOMT44	R： AGCTATGATCTTTCCATCATCAGG
MsCCoAOMT23	F： GAGATGACACTATCACACCCT	MsActin	F： GACAATGGAACTGGAATGG
MsCCoAOMT23	R： AAGCCAATACCTTTCCATCAG	MsActin	R： CAATACCGTGCTCAATGG

基因名称 Gene name	引物序列 Primer sequence （5'-3'）	基因名称 Gene name	引物序列 Primer sequence （5'-3'）
MsCCoAOMT1	F： TGCTGATCCATTGGTAAGTGAC	MsCCoAOMT25	F： CTATACCCGGTGATGAAGGAC
MsCCoAOMT1	R： TTGTCATCCCATCTCCAATAGGT	MsCCoAOMT25	R： CAAAGCCAATACCTTTCCATCAG
MsCCoAOMT10	F： TTCATGGGCACTTCACCT	MsCCoAOMT32	F： CTATACCCGCTGATGAAGGAC
MsCCoAOMT10	R： GGCTGTAATCTTTCCATCATATGG	MsCCoAOMT32	R： AGCCAACACCTTTCCATCCT
MsCCoAOMT12	F： AAGCAAACTGAATCTGGAAGAC	MsCCoAOMT41	F： GGAACCTTATGGCTACACCT
MsCCoAOMT12	R： TTGTCATGATGTTCCATGGGT	MsCCoAOMT41	R： AAGCCAATACCTTTCCATCAG
MsCCoAOMT17	F： TGCCTTTGGATGAAGCAC	MsCCoAOMT43	F： CACCCATGCTTGAAGGAG
MsCCoAOMT17	R： CAATTCCTATTACCTTGCCATCAG	MsCCoAOMT43	R： AGCTAACACCTTTCCATCCT
MsCCoAOMT21	F： GGCTGGTCAACTAATCACTC	MsCCoAOMT44	F： CTAATGGGCATACTCTTGAAGCT
MsCCoAOMT21	R： GGCTGTAATCTTTCCATCGT	MsCCoAOMT44	R： AGCTATGATCTTTCCATCATCAGG
MsCCoAOMT23	F： GAGATGACACTATCACACCCT	MsActin	F： GACAATGGAACTGGAATGG
MsCCoAOMT23	R： AAGCCAATACCTTTCCATCAG	MsActin	R： CAATACCGTGCTCAATGG

基因名称 Gene name	基因座 Gene ID	蛋白质大小 Protein length （aa）	分子量MW （kDa）	等电点 pI	疏水性指数 GRAVY	基因序列长度Length of intron and exon （bp）	亚细胞定位Subcellular localization	拟南芥同源基因 Homologous gene of Arabidopsis
MsCCoAOMT1	MS.gene039184.t1	309	34.3566	8.54	-0.123	5315	Cytoplasm	AT3G62000.1
MsCCoAOMT2	MS.gene068675.t1	293	32.6967	8.58	-0.083	3724	Chloroplast	AT3G62000.1
MsCCoAOMT3	MS.gene063440.t1	293	32.7298	8.58	-0.061	3345	Chloroplast	AT3G62000.1
MsCCoAOMT4	MS.gene062840.t1	267	29.9507	8.58	-0.080	7396	Chloroplast	AT3G62000.1
MsCCoAOMT5	MS.gene049025.t1	251	27.9613	5.51	0.020	1473	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT6	MS.gene26463.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1302	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT7	MS.gene06173.t1	235	26.1382	5.51	-0.023	1495	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT8	MS.gene058635.t1	133	14.8534	5.59	0.041	724	N and C	AT1G67980.1
MsCCoAOMT9	MS.gene028389.t1	229	25.7237	5.14	-0.114	2386	Chloroplast	AT1G67980.1
MsCCoAOMT10	MS.gene55886.t1	235	26.0962	5.51	-0.043	1495	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT11	MS.gene28756.t1	229	25.7418	5.23	-0.097	1842	Chloroplast	AT1G67980.1
MsCCoAOMT12	MS.gene059423.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1303	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT13	MS.gene053535.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1303	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT14	MS.gene053539.t1	248	28.0291	5.41	-0.280	1303	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT15	MS.gene053537.t1	182	20.5040	6.31	-0.066	881	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT16	MS.gene20157.t1	235	26.1222	5.51	-0.023	1492	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT17	MS.gene35069.t1	229	25.7377	5.14	-0.112	2454	Chloroplast	AT1G67980.1
MsCCoAOMT18	MS.gene047856.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1322	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT19	MS.gene064029.t1	238	26.8580	5.23	-0.174	2072	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT20	MS.gene030303.t1	238	26.8720	5.35	-0.175	2087	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT21	MS.gene75055.t1	238	26.9041	5.35	-0.182	2042	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT22	MS.gene66349.t1	238	26.8580	5.23	-0.174	2072	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT23	MS.gene44534.t1	238	26.7568	5.58	-0.132	1866	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT24	MS.gene44535.t1	568	63.5446	4.89	-0.170	4423	Chloroplast	AT2G23250.1
MsCCoAOMT25	MS.gene011784.t1	248	27.9000	5.15	-0.173	3149	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT26	MS.gene011803.t1	248	27.8408	4.99	-0.198	3883	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT27	MS.gene011804.t1	246	27.7320	5.50	-0.130	1624	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT28	MS.gene30425.t1	187	20.9131	5.22	-0.100	2679	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT29	MS.gene011778.t1	238	26.7828	5.48	-0.124	2777	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT30	MS.gene56811.t1	248	27.8449	5.06	-0.158	4031	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT31	MS.gene56793.t1	248	27.8689	4.99	-0.185	3744	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT32	MS.gene56792.t1	189	21.6996	5.65	0.286	1330	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT33	MS.gene074442.t1	235	26.3723	5.52	-0.197	3568	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT34	MS.gene90469.t1	238	26.7828	5.48	-0.124	1850	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT35	MS.gene90479.t1	248	27.9000	5.15	-0.173	2947	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT36	MS.gene90498.t1	248	27.8127	4.91	-0.182	3043	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT37	MS.gene90499.t1	246	27.7240	5.50	-0.108	1637	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT38	MS.gene051092.t1	235	26.4173	5.30	-0.186	3565	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT39	MS.gene041940.t1	238	26.7828	5.48	-0.124	2498	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT40	MS.gene041950.t1	248	27.9071	5.16	-0.160	2984	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT41	MS.gene99216.t1	248	27.8408	4.99	-0.195	3776	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT42	MS.gene99215.t1	246	27.7351	5.50	-0.034	1458	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT43	MS.gene99213.t1	246	27.7460	5.50	-0.129	1637	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT44	MS.gene25100.t1	235	26.4394	5.55	-0.185	3584	Cytoplasm	AT4G26220.1

基因名称 Gene name	基因座 Gene ID	蛋白质大小 Protein length （aa）	分子量MW （kDa）	等电点 pI	疏水性指数 GRAVY	基因序列长度Length of intron and exon （bp）	亚细胞定位Subcellular localization	拟南芥同源基因 Homologous gene of Arabidopsis
MsCCoAOMT1	MS.gene039184.t1	309	34.3566	8.54	-0.123	5315	Cytoplasm	AT3G62000.1
MsCCoAOMT2	MS.gene068675.t1	293	32.6967	8.58	-0.083	3724	Chloroplast	AT3G62000.1
MsCCoAOMT3	MS.gene063440.t1	293	32.7298	8.58	-0.061	3345	Chloroplast	AT3G62000.1
MsCCoAOMT4	MS.gene062840.t1	267	29.9507	8.58	-0.080	7396	Chloroplast	AT3G62000.1
MsCCoAOMT5	MS.gene049025.t1	251	27.9613	5.51	0.020	1473	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT6	MS.gene26463.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1302	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT7	MS.gene06173.t1	235	26.1382	5.51	-0.023	1495	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT8	MS.gene058635.t1	133	14.8534	5.59	0.041	724	N and C	AT1G67980.1
MsCCoAOMT9	MS.gene028389.t1	229	25.7237	5.14	-0.114	2386	Chloroplast	AT1G67980.1
MsCCoAOMT10	MS.gene55886.t1	235	26.0962	5.51	-0.043	1495	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT11	MS.gene28756.t1	229	25.7418	5.23	-0.097	1842	Chloroplast	AT1G67980.1
MsCCoAOMT12	MS.gene059423.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1303	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT13	MS.gene053535.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1303	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT14	MS.gene053539.t1	248	28.0291	5.41	-0.280	1303	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT15	MS.gene053537.t1	182	20.5040	6.31	-0.066	881	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT16	MS.gene20157.t1	235	26.1222	5.51	-0.023	1492	Chloroplast	AT4G26220.1
MsCCoAOMT17	MS.gene35069.t1	229	25.7377	5.14	-0.112	2454	Chloroplast	AT1G67980.1
MsCCoAOMT18	MS.gene047856.t1	247	27.9992	5.55	-0.308	1322	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT19	MS.gene064029.t1	238	26.8580	5.23	-0.174	2072	Cytoplasm	AT4G26220.1
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MsCCoAOMT22	MS.gene66349.t1	238	26.8580	5.23	-0.174	2072	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT23	MS.gene44534.t1	238	26.7568	5.58	-0.132	1866	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT24	MS.gene44535.t1	568	63.5446	4.89	-0.170	4423	Chloroplast	AT2G23250.1
MsCCoAOMT25	MS.gene011784.t1	248	27.9000	5.15	-0.173	3149	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT26	MS.gene011803.t1	248	27.8408	4.99	-0.198	3883	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT27	MS.gene011804.t1	246	27.7320	5.50	-0.130	1624	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT28	MS.gene30425.t1	187	20.9131	5.22	-0.100	2679	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT29	MS.gene011778.t1	238	26.7828	5.48	-0.124	2777	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT30	MS.gene56811.t1	248	27.8449	5.06	-0.158	4031	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT31	MS.gene56793.t1	248	27.8689	4.99	-0.185	3744	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT32	MS.gene56792.t1	189	21.6996	5.65	0.286	1330	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT33	MS.gene074442.t1	235	26.3723	5.52	-0.197	3568	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT34	MS.gene90469.t1	238	26.7828	5.48	-0.124	1850	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT35	MS.gene90479.t1	248	27.9000	5.15	-0.173	2947	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT36	MS.gene90498.t1	248	27.8127	4.91	-0.182	3043	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT37	MS.gene90499.t1	246	27.7240	5.50	-0.108	1637	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT38	MS.gene051092.t1	235	26.4173	5.30	-0.186	3565	Cytoplasm	AT4G26220.1
MsCCoAOMT39	MS.gene041940.t1	238	26.7828	5.48	-0.124	2498	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT40	MS.gene041950.t1	248	27.9071	5.16	-0.160	2984	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT41	MS.gene99216.t1	248	27.8408	4.99	-0.195	3776	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT42	MS.gene99215.t1	246	27.7351	5.50	-0.034	1458	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT43	MS.gene99213.t1	246	27.7460	5.50	-0.129	1637	Cytoplasm	AT4G34050.1
MsCCoAOMT44	MS.gene25100.t1	235	26.4394	5.55	-0.185	3584	Cytoplasm	AT4G26220.1

基因名称 Gene name	元件名称Element name
	基本核心元件 Basic core components				光信号感知顺式作用元件Optical signal sensing cis-acting element						激素响应元件 Hormone response element									生物应激反应元件 Biological stress response element					蛋白质结合元件 Protein binding element				组织发育元件 Tissue development element
	X₁	X₂	X₃	X₄	X₅	X₆	X₇	X₈	X₉	X₁₀	X₁₁	X₁₂	X₁₃	X₁₄	X₁₅	X₁₆	X₁₇	X₁₈	X₁₉	X₂₀	X₂₁	X₂₂	X₂₃	X₂₄	X₂₅	X₂₆	X₂₇	X₂₈	X₂₉	X₃₀	X₃₁	X₃₂
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Ms₃	43	14	3	2	3	1	4	0	0	0	1	0	0	2	1	1	1	2	0	2	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₄	33	11	0	0	2	2	2	0	2	0	3	0	0	1	2	1	1	1	0	0	0	0	1	0	0	1	0	1	0	1	0	0
Ms₅	35	39	1	0	3	1	2	0	0	2	0	1	1	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	1	0	1	0	0	2	0	0	0
Ms₆	32	47	1	0	2	4	1	2	0	0	2	0	0	1	0	1	0	1	0	3	1	1	1	1	0	0	0	0	0	0	0	1
Ms₇	35	39	1	0	3	1	2	0	0	2	0	1	1	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	1	0	1	0	0	2	0	0	0
Ms₈	41	51	1	0	2	4	3	1	0	0	3	0	1	1	1	0	0	1	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₉	39	56	1	0	2	4	3	1	0	0	2	0	1	1	1	0	0	1	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₁₀	35	39	1	0	3	1	2	0	0	2	0	1	1	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	1	0	1	0	0	2	0	0	0
Ms₁₁	38	54	0	0	4	1	3	2	0	0	1	0	1	2	1	0	0	2	0	1	0	3	1	0	1	0	0	3	0	0	0	0
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Ms₁₄	23	75	0	0	2	2	2	2	0	0	1	0	0	1	0	2	0	1	0	2	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	1
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Ms₁₆	35	39	1	0	3	1	2	0	0	2	0	1	1	0	0	0	0	0	0	1	0	0	0	1	0	1	0	0	2	0	0	0
Ms₁₇	39	56	1	0	2	4	3	1	0	0	2	0	1	1	1	0	0	1	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₁₈	32	48	1	0	2	3	2	1	0	0	1	0	0	1	0	1	0	1	0	2	2	1	0	1	0	0	0	0	0	0	0	1
Ms₁₉	44	60	0	0	3	3	0	0	1	1	3	0	0	1	0	0	0	1	0	3	0	2	0	3	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₂₀	39	43	0	0	5	2	0	0	0	0	2	0	0	2	0	0	0	2	0	2	0	1	0	1	1	0	0	0	0	1	0	0
Ms₂₁	43	60	0	0	2	3	0	0	1	1	3	0	0	1	0	0	0	1	0	3	0	1	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₂₂	44	61	0	0	2	3	0	0	1	1	3	0	0	1	0	0	0	1	0	2	0	1	0	2	0	0	0	0	0	0	0	0
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Ms₂₆	29	21	0	0	0	2	2	0	0	1	0	0	2	1	0	0	1	1	0	2	0	2	1	0	0	1	0	3	1	0	0	0
Ms₂₇	39	53	0	0	4	2	1	1	1	0	3	0	1	1	0	1	0	1	0	2	0	1	2	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₂₈	53	46	1	1	5	4	3	0	0	0	2	0	1	0	0	0	0	0	0	4	0	0	0	0	0	0	0	0	1	1	0	0
Ms₂₉	40	27	1	1	4	2	3	1	0	0	3	0	0	1	0	1	1	1	0	2	0	0	1	1	0	0	0	0	1	0	0	0
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Ms₃₁	39	56	0	0	3	2	0	0	0	0	3	0	0	1	1	0	0	1	0	0	0	0	1	0	1	1	0	2	0	0	0	0
Ms₃₂	47	43	0	1	0	1	1	0	0	0	1	0	1	1	0	0	2	0	0	4	0	0	1	0	0	0	0	2	0	0	0	0
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Ms₃₆	33	64	0	1	3	1	4	0	0	0	2	0	0	2	1	0	0	2	0	1	0	0	1	0	1	0	1	2	0	0	0	0
Ms₃₇	44	67	0	1	5	1	0	2	1	0	1	0	1	1	0	0	2	1	0	1	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0
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Ms₃₉	42	26	1	1	4	2	3	1	0	0	2	0	0	3	0	1	1	3	0	2	0	0	1	0	0	0	0	0	1	0	0	0
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Ms₄₁	40	59	0	1	3	2	0	0	0	0	3	0	0	2	1	0	0	2	0	1	0	0	1	0	1	1	0	2	0	0	0	0
Ms₄₂	44	61	0	1	4	1	0	1	1	0	1	0	1	1	0	0	2	1	0	1	0	0	1	1	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₄₃	44	65	0	1	4	1	0	2	1	0	1	0	1	1	0	0	2	1	0	1	0	0	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0
Ms₄₄	48	23	0	1	3	2	1	0	0	0	1	0	2	1	1	0	0	1	0	4	0	1	0	0	0	0	0	0	0	1	0	0

紫花苜蓿CCoAOMT基因家族的鉴定、进化及表达分析

Identification， evolution and expression analysis of the CCoAOMT family genes in Medicago sativa

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